开篇是公司知道了异形的存在，并且派出了一艘舰艇捕捉异形的残骸，在找到异形1里最后被猪脚弹出仓外的异形后，公司惊讶的发现，这只异形在如此残酷的生存环境中竟然没有死，并成功从这只异形身体中提取了黑水（这也贴合了前传普罗米修斯），因为在当时，人类外太空中的殖民已经捉襟见肘，人类自身的进化程度远不及环境的变化，于是公司计划用黑水让人类进化成异形那样的超级生物，并且通过这只残存的异形中繁殖出无数抱脸虫，打算带回殖民地研究，不出意外的，异形大杀四方，很快占据了这艘飞船。

很久以后，镜头回到本作猪脚这边，她是这个殖民星球的工人，身边有一个异形系列不可或缺的机器人陪伴，她攒够了工时，想要逃离这个不见天日的阴暗星球，却被公司告知工时加了一倍，猪脚愤怒的带着机器人找到了她的四个好基友，分别是兄妹两、小白（痴）和中国妹子，他们驾驶着自己的飞船直奔已经被异形占领的飞船（当然他们不知道这艘船发生了什么，只认为这是艘报废的破船），因为这艘船上有大量的冷却剂和休眠仓，可以让他们逃离这个殖民星球去一个有太阳照耀的地方。中间有个插曲，妹妹怀孕了，这位最终结局留下了伏笔。

机器人（具有开门特技）、小白和哥哥顺利登上飞船，他们奇怪的发现这里有一具机器人残缺的尸体，并且船体被烧了一个大洞，他们并没有在意，也顺利的找到了休眠仓并运回了自己的飞船，但是奈何冷却剂不足以支撑他们的行程，于是几人继续寻找，并在一个冷库里找到了冷却剂，在拆除冷却剂时意外发生，冷库的门被锁死，连机器人也无法打开，几人被困在了冷库里。猪脚和中国妹子为了解救众人，从自己的飞船中来到了大船，猪脚从机器人残骸中拿走了他的芯片，认为这可以帮助打开冷库。猪脚将芯片放入机器人身体，同时冷库因为被拿走了冷却剂，开始快速升温，其中保存的抱脸虫大量解冻开始活动，众人一路拼杀终于从冷库中跑了出来，可不幸的是中国妹子仍然被一只抱脸虫捉住亲了嘴，这时候被植入芯片的机器人同时被植入了命令：保护公司利益，将黑水带回殖民地，残缺的老机器人也被唤醒。老机器人警告众人，中国妹子已经被寄生，不能带她回飞船，但小白明显跟中国妹子有一腿，拼了命把其他人关在了大船里，带着中国妹子跑回了自己的飞船。结果中国妹子体内的异形迅速破体而出，杀死了中国妹子，小船失控，直接撞向了大船，小白也被异形杀死，撞击导致大船偏离航线，直接奔着小行星带撞了过去，时间仅剩四十分钟。妹妹直接跑到了大船，但是被异形跟踪，众人只能眼瞅着她被异形抓走。剩余众人拿到了两把步枪，一路狂奔，杀到了异形巢穴，哥哥惊讶的发现妹妹没有死并且把她救了下来，但是妹妹伤很重，也正因为这个没有被寄生，在于异形的搏斗中哥哥下线，机器人负伤倒地，猪脚和妹妹乘电梯逃了出去（忘了说了，他们还带着公司提取的黑水，因为机器人已经得到命令将黑水带回去研究），为了救机器人，猪脚又重返巢穴和机器人并肩作战（同时猪脚将机器人体中的新芯片取出，恢复了机器人最初形态），跟异形大战三百回合，两人拼死逃回小船，将妹妹放入休眠仓，谁知濒死的妹妹已经注射了黑水，一种全新的异形在她身体里诞生了，异形刚出生的时候被卵衣包裹，长的和人类婴儿十分相像，但是以惊人的速度生长，成熟后面容几乎和普罗米修斯里的造物者一毛一样，人类异形一巴掌抽报废了机器人，然后把他亲娘也给炫了，猪脚和他展开搏斗，最后很程序化的把他弄出了飞船扔进了小行星带，然后把机器人和自己放进了休眠仓，奔向了有太阳的星球，就此完结。

这一部异形还是可以的，惊悚程度仅次于第一部，剧情安排也合理，各种异形元素齐全，异形死忠粉必看之作